巫縣是東漢荊州南郡最西端的屬縣，位於長江巫峽一帶，是三峽水道上連接益州與荊州的咽喉。
建安年間，南郡西部的巫縣一帶劃歸宜都郡。劉備失荊州後，這裡成為蜀漢與東吳對峙的前線。章武元年（221 年）劉備東征，蜀將吳班、馮習自巫縣擊破吳將李異等人，進駐秭歸，揭開夷陵之戰的序幕。戰後巫縣歸東吳所有。吳永安三年（260 年）分宜都郡設建平郡，郡治就在巫縣，以防禦西面的蜀漢與後來的西晉。